Câu chuyện của "Biên niên sử võ lâm 2" xảy ra mười năm trước "Biên niên sử võ lâm 1", ba môn phái lớn của võ thuật ngoại lai là Tianwaitian, Five Elements Palace và King Kong Sect, xâm chiếm vùng đồng bằng trung tâm, phái Tianshan và Jianghu giáo phái bị tiêu diệt. Nhân vật chính vốn là đệ tử của phái Thiên Sơn, nhưng tình cờ lại trở thành sát thủ khét tiếng nhất giang hồ. Tác phẩm này kể về câu chuyện của nhân vật chính liên kết với các anh hùng từ mọi tầng lớp trong võ lâm để trục xuất võ thuật ngoại lai, tạo ra một môn phái mới và khôi phục lại trật tự của võ thuật Trung Nguyên.
